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蛋白質(zhì)純化的方法選擇
  • 發(fā)布日期:2017-09-07     信息來(lái)源:      瀏覽次數(shù):4369
    • 隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,越來(lái)越多的科研人員熟練掌握了分子生物學(xué)的各種試驗(yàn)技術(shù),并研制成套試劑盒,使基因克隆表達(dá)變得越來(lái)越容易。但分子生物學(xué)的上游工作往往并非是zui終目的,分子克隆與表達(dá)的關(guān)鍵是要拿到純的表達(dá)產(chǎn)物,以研究其生物學(xué)作用,或者大量生產(chǎn)出可用于疾病治療的生物制品。相對(duì)與上游工作來(lái)說(shuō),分子克隆的下游工作顯得更難,蛋白純化工作非常復(fù)雜,除了要保證純度外,蛋白產(chǎn)品還必須保持其生物學(xué)活性。純化工藝必須能夠每次都能產(chǎn)生相同數(shù)量和質(zhì)量的蛋白,重復(fù)性良好。這就要求應(yīng)用適應(yīng)性非常強(qiáng)的方法而不是用能得到純蛋白的方法去純化蛋白。在實(shí)驗(yàn)室條件下的好方法卻可能在大規(guī)模生產(chǎn)應(yīng)用中失敗,因?yàn)楹笳咭笠?guī)?;?,且在每日的應(yīng)用中要有很好的重復(fù)性。本文綜述了蛋白質(zhì)純化的基本原則和各種蛋白純化技術(shù)的原理、優(yōu)點(diǎn)及局限性,以期對(duì)蛋白純化的方法選擇及整體方案的制定提供一定的指導(dǎo)。

      1 蛋白純化的一般原則
      蛋白純化要利用不同蛋白間內(nèi)在的相似性與差異,利用各種蛋白間的相似性來(lái)除去非蛋白物質(zhì)的污染,而利用各蛋白質(zhì)的差異將目的蛋白從其他蛋白中純化出來(lái)。每種蛋白間的大小、形狀、電荷、疏水性、溶解度和生物學(xué)活性都會(huì)有差異,利用這些差異可將蛋白從混合物如大腸桿菌裂解物中提取出來(lái)得到重組蛋白。蛋白的純化大致分為粗分離階段和精細(xì)純化階段二個(gè)階段。粗分離階段主要將目的蛋白和其他細(xì)胞成分如DNA、RNA等分開(kāi),由于此時(shí)樣本體積大、成分雜,要求所用的樹(shù)脂高容量、高流速,顆粒大、粒徑分布寬.并可以迅速將蛋白與污染物分開(kāi),防止目的蛋白被降解。精細(xì)純化階段則需要更高的分辨率,此階段是要把目的蛋白與那些大小及理化性質(zhì)接近的蛋白區(qū)分開(kāi)來(lái),要用更小的樹(shù)脂顆粒以提高分辨純化的*步,它可以初步粗提蛋白質(zhì),去除非蛋白成分。蛋白質(zhì)在硫酸銨沉淀中較穩(wěn)定,可以短期在這種狀態(tài)下保存中間產(chǎn)物,當(dāng)前蛋白質(zhì)純化多采用這種辦法進(jìn)行粗分離翻。在規(guī)?;a(chǎn)上硫酸銨沉淀方法仍存在一些問(wèn)題,硫酸銨對(duì)不銹鋼器具的腐蝕性很強(qiáng)。其他的鹽如硫酸鈉不存在這種問(wèn)題,但其純化效果不如硫酸銨。除了鹽析外蛋白還可以用多聚物如PEG和防凍劑沉淀出來(lái),PEG是一種惰性物質(zhì),同硫酸銨一樣對(duì)蛋白有穩(wěn)定效果,在緩慢攪拌下逐漸提高冷的蛋白溶液中的PEG濃度,蛋白沉淀可通過(guò)離心或過(guò)濾獲得,蛋白可在這種狀態(tài)下長(zhǎng)期保存而不損壞。 蛋白沉淀對(duì)蛋白純化來(lái)說(shuō)并不是多么好的方法,因?yàn)樗荒苓_(dá)到幾倍的純化效果,而我們?cè)谶_(dá)到目的前需要上千倍的純化。其好處是可以把蛋白從混雜有蛋白酶和其他有害雜質(zhì)的培養(yǎng)基及細(xì)胞裂解物中解脫出來(lái)。

      2 緩沖液的更換
      雖然更換緩沖液不能提高蛋白純度,但它卻在蛋白純化方案中起著極其重要的作用。不同的蛋白純化方法需要不同pH及不同離子強(qiáng)度的緩沖液。假如你用硫酸銨將蛋白沉淀出來(lái),毫無(wú)疑問(wèn)蛋白是處在高鹽環(huán)境中,需要想辦法脫鹽,可用的方法有利用半透膜透析,通過(guò)勤換透析液體去除鹽分,此法尚可,但需幾個(gè)小時(shí),通常要過(guò)夜,也難以用予大規(guī)模純化中。新型的設(shè)備將透析膜夾在兩個(gè)板中間,板的一側(cè)加緩沖液,另一側(cè)加需脫鹽的蛋白溶液,并在蛋白溶液一側(cè)通過(guò)泵加壓,可以使兩側(cè)溶液在數(shù)小時(shí)內(nèi)達(dá)到平衡,若增加對(duì)蛋白溶液的壓力,還可迫使水分和鹽更多通過(guò)透析膜進(jìn)入透析液達(dá)到對(duì)蛋白濃縮的目的。也有出售的脫鹽柱,柱內(nèi)的填料是小孔徑的顆粒,蛋白分子不能進(jìn)入孔內(nèi),先于高濃度鹽離子從柱中流出,從而使二者分離。蛋白純化的每一步都會(huì)造成目的蛋白的丟失,緩沖液平衡的步驟尤甚。蛋白會(huì)結(jié)合在任何它能接觸的表面上,剪切力、起泡沫和離子強(qiáng)度的快速變化很容易讓蛋白失活。

      3 離子交換色譜
      這是在所有的蛋白純化與濃縮方法中zui有效方法?;诘鞍着c離子交換樹(shù)脂間的相互電荷作用,通過(guò)選擇不同的緩沖液,同一種蛋白既可以和陰離子交換樹(shù)脂(能結(jié)合帶負(fù)電荷的分子)結(jié)合,也可以和陽(yáng)離子交換樹(shù)脂結(jié)合。樹(shù)脂所用的帶電基團(tuán)有四種:二乙基氨基乙基用于弱的陰離子交換樹(shù)脂;羧甲基用于弱的陽(yáng)離子交換樹(shù)脂;季銨用于強(qiáng)陰離子交換樹(shù)脂;甲基磺酸酯用于強(qiáng)陽(yáng)離子交換樹(shù)脂。蛋白質(zhì)由氨基酸組成,氨基酸在不同的pH環(huán)境中所帶總電荷不同。大多數(shù)蛋白在生理pH(pH 6—8)下帶負(fù)電荷,需用陰離子交換柱純化,的pH下蛋白會(huì)變性失活.應(yīng)盡量避免。由于在某個(gè)特定的pH下不同的蛋白所帶電荷數(shù)不同,與樹(shù)脂的結(jié)合力也不同,隨著緩沖液中鹽濃度的增加或pH的變化,蛋白按結(jié)合力的強(qiáng)弱被依次洗脫 。在工業(yè)化生產(chǎn)中更多地是改變鹽濃度而不是去改變pH值,因?yàn)榍罢吒菀卓刂?。在實(shí)驗(yàn)室中幾乎總是用鹽濃度梯度去洗脫離子交換柱,利用泵的輔助可以使流入柱的緩沖液中鹽濃度平穩(wěn)地上升,當(dāng)離子強(qiáng)度能夠中和蛋白的電荷時(shí),蛋白就被從柱上洗脫下來(lái)。但在工業(yè)生產(chǎn)中鹽濃度很難控制,所以常用分步洗脫而不足連續(xù)升高的鹽梯度。與排阻層析相比,離子交換特異性更好,有更多的參數(shù)可以調(diào)整以獲得*的純化效果,樹(shù)脂也比較便宜。值得一提的是,即便是用zui控制的條件,僅用離子交換單一的方法也得不到純的蛋白,還需要其他的純化步驟。

      4 親和層析
      親和層析基于目的蛋白與固相化的配基特異結(jié)合而滯留,其他雜蛋白會(huì)流過(guò)柱子。本方法存在的問(wèn)題是:?jiǎn)慰狗浅0嘿F,而且也需先純化;單抗與目的蛋白結(jié)合力太強(qiáng).要用苛刻的條件來(lái)洗脫,這會(huì)使目的蛋白失活并破壞單抗;混合物中的其他蛋白如蛋白酶也可能破壞抗體或與它們非特異結(jié)合;某些單抗也會(huì)在純化過(guò)程中從樹(shù)脂上解離下來(lái)混入產(chǎn)物中,也需要從終產(chǎn)物中去除。親和柱通常在純化過(guò)程的后期應(yīng)用,此時(shí)標(biāo)本體積已縮小,大部分的雜質(zhì)已經(jīng)去除。谷胱甘肽S一轉(zhuǎn)移酶(Glutathione S—transferase,GST)是

      zui常用的親和層析純化標(biāo)簽之一,帶有此標(biāo)簽的重組蛋白可用交聯(lián)谷胱甘肽的層析介質(zhì)純化,但本方法有以下缺點(diǎn):首先,蛋白上的GST必須能合適地折疊,形成與谷胱甘肽結(jié)合的空間結(jié)構(gòu)才能用此方法純化;其次,GST標(biāo)簽多達(dá)220個(gè)氨基酸,如此大的標(biāo)簽可能會(huì)影響表達(dá)蛋白的可溶性,使形成包涵體,這會(huì)破壞蛋白的天然結(jié)構(gòu),難于進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,有時(shí)即便純化后再酶切去除GST標(biāo)簽也不一定能解決問(wèn)題。另一種可應(yīng)用的親和純化標(biāo)簽是6組氨酸標(biāo)簽,組氨酸的咪唑側(cè)鏈可親和結(jié)合鎳、鋅和鈷等金屬離子,在中性和弱堿性條件下帶組氨酸標(biāo)簽的目的蛋白與鎳柱結(jié)合,在低pH下用咪唑競(jìng)爭(zhēng)洗脫。組氨酸標(biāo)簽與GST相比有許多優(yōu)點(diǎn),首先,由于只有6個(gè)氨基酸,分子量很小,一般需要酶切去除:其次,可以在變性條件下純化蛋白,在高濃度的尿素和胍中仍能保持結(jié)合力;另外6組氨酸標(biāo)簽無(wú)免疫原性,重組蛋白可直接用來(lái)注射動(dòng)物,也不影響免疫學(xué)分析 。雖然有這么多的優(yōu)點(diǎn),但此標(biāo)簽仍有不足,如目的蛋白易形成包涵體、難以溶解、穩(wěn)定性差及錯(cuò)誤折疊等。鎳柱純化時(shí)金屬鎳離子容易脫落漏出混入蛋白溶液,不但會(huì)通過(guò)氧化破壞目的蛋白的氨基酸側(cè)鏈,而且柱子也會(huì)非特異吸附蛋白質(zhì),影響純化效果。若目的蛋白可與某種碳水化合物特異結(jié)合,或者需要某種特殊的輔因子,可將該碳水化合物或輔因子固相化制成親和柱,結(jié)合后目的蛋白可用高濃度的碳水化合物或輔因子洗脫。

      5 疏水作用層析
      疏水作用層析蛋白是由疏水性和親水性氨基酸組成的。疏水性氨基酸位于蛋白空間結(jié)構(gòu)的中心部位,遠(yuǎn)離表面的水分子。親水性氨基酸殘基則位于蛋白表面。由于親水性氨基酸吸引了許多的水分子,所以通常情況下整個(gè)蛋白分子被水分子包圍著,疏水性氨基酸不會(huì)暴露在外。在高鹽濃度的環(huán)境中蛋白的疏水性區(qū)域則會(huì)暴露并與疏水性介質(zhì)表面的疏水性配基結(jié)合。不同的蛋白疏水性不同,與疏水作用力大小也不同,通過(guò)逐漸降低緩沖液中鹽濃度沖洗柱子,在鹽濃度很低時(shí),蛋白恢復(fù)自然狀態(tài),疏水作用力減弱被洗脫出來(lái)。 疏水性樹(shù)脂的選擇性是由疏水性配基的結(jié)構(gòu)決定的,常用的直鏈配體為烷基配體(alkyl ligands)和芳基配體(arylligands),鏈越長(zhǎng)結(jié)合蛋白的能力也越強(qiáng)。理想樹(shù)脂種類的選擇應(yīng)根據(jù)目的蛋白的化學(xué)性質(zhì)而定,不能選擇結(jié)合力太強(qiáng)的樹(shù)脂,結(jié)合力太強(qiáng)的樹(shù)脂會(huì)很難洗脫,所以開(kāi)始時(shí)應(yīng)選用中等結(jié)合力的苯基樹(shù)脂探討條件。為了使選擇合適的介質(zhì)更容易,Amersham Biosciences推出了疏水作用樹(shù)脂選擇試劑盒,里面包括5種不同的樹(shù)脂供比較。疏水層析很適合作為離子交換純化的下一個(gè)步驟,因?yàn)槭杷饔脤游鲈诟啕}濃度下上樣,從離子交換得到的產(chǎn)物不需更換緩沖液即可使用。蛋白又在低鹽緩沖液中洗脫,又省去了下一步純化前的更換緩沖液的步驟,既節(jié)約了時(shí)間,又減少了蛋白的丟失。

      6 排阻層析
      也叫凝膠過(guò)濾或分子篩。排阻層析柱的填充顆粒是多孔的介質(zhì),柱中圍繞著顆粒所能容納的液體量叫流動(dòng)相,也稱無(wú)效體積。太大的蛋白不能進(jìn)入顆粒的孔內(nèi),只能存在于無(wú)效體積的溶液中,將會(huì)zui早從柱中洗脫出來(lái),對(duì)這部分蛋白無(wú)純化效果。由于各種蛋白的分子大小不同,擴(kuò)散進(jìn)入特定大小孔徑顆粒內(nèi)的能力也各異。大的蛋白分子會(huì)被先洗脫出來(lái),分子越小,洗脫出來(lái)的越晚。為得到*的純化效果,應(yīng)將孔徑大小選在目的蛋白能在無(wú)效體積和總柱床體積的中點(diǎn)附近洗脫。排阻層析有其他方法所不具備的優(yōu)點(diǎn),首先所能純化的蛋白分子量范圍寬,Tosoh Biosep公司的聚合物樹(shù)脂,排阻極限可達(dá)20o000kD;其次,樹(shù)脂微孔的形狀適合分離球形的蛋白質(zhì),純化過(guò)程中也不需要能引起蛋白變性的有機(jī)溶劑。應(yīng)該注意的是某些蛋白不適合用凝膠過(guò)濾純化,因?yàn)楸炯夹g(shù)所用樹(shù)脂有輕度的親水性,電荷密度較高的蛋白容易吸附在上面。排阻層析從不用于純化過(guò)程的早期,因?yàn)檫@種方法要求標(biāo)本高度濃縮,上樣量只能在柱體積的1%--4%之間,柱子要細(xì)而長(zhǎng)才能得到好的分離效果,樹(shù)脂本身也比較昂貴,規(guī)?;墓I(yè)生產(chǎn)中不太適用。

      7 電泳
      丙烯酰胺凝膠電泳通常用來(lái)查看蛋白混合物樣品的復(fù)雜程度和監(jiān)測(cè)純化效果。這種方法分離效果*,可惜很難在不喪失精度情況下放大到制備規(guī)模,因?yàn)殡S著膠厚度的增加,電泳時(shí)的熱效應(yīng)會(huì)嚴(yán)重干擾蛋白的泳動(dòng)。在基礎(chǔ)研究中,有時(shí)僅需要少量的純蛋白進(jìn)行研究,如蛋白質(zhì)測(cè)序等,此時(shí)電泳純化不失為一種簡(jiǎn)便快速的好方法。丙烯酰胺凝膠電泳也是蛋白純化過(guò)程中重要的分析工具,可以檢測(cè)目的蛋白是在哪個(gè)梯度的離子交換柱鹽洗脫液中;可用來(lái)判定近年來(lái)隨著各學(xué)科的迅猛發(fā)展,對(duì)蛋白純化技術(shù)的需求不斷增長(zhǎng),已有的純化方法被日益改進(jìn),新型的純化方法也相繼涌現(xiàn)。羥磷灰石是磷酸鈣的結(jié)晶,由于其理化性質(zhì)不夠穩(wěn)定,結(jié)合能力差,很難用于層析。

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